Từ lâu, tộc Grongi (グロンギ, Gurongi?) đã khủng bố tộc Linto (リント, Rinto?), tổ tiên của loài người cho đến khi một chiến binh tên là Kuuga (クウガ, Kūga?) xuất hiện và đánh bại các Grongi, niêm phong tộc trưởng trong một hang động. Ngày nay, thắt lưng đá bí ẩn của Kuuga được khai quật, giải phong ấn Grongi giúp chúng hồi sinh và tiếp tục trò chơi của chúng bằng cách giết chết hậu duệ của tộc Linto, tức loài người. Một thanh niên đa tài tên là Godai Yuusuke đã phát hiện ra bản thân có một mối liên hệ nào đó với chiếc thắt lưng đá bí ẩn kia và trở thành Kamen Rider Kuuga chiến đấu với tộc Grongi. Anh đã giúp tập hợp Cảnh sát Khoa học để chiến đấu với Grongi, sử dụng các sức mạnh khác nhau của Kuuga để ngăn chặn và đánh bại chúng, bảo vệ nụ cười cho mọi người. Nhưng khi cuộc chiến cuối cùng đến gần, Yuusuke khám phá ra bí mật khủng khiếp về mối liên hệ giữa Kuuga và tộc trưởng tộc Grongi.